Banco de Proyectos UNM
Código - Título:
PICYDT-CAyT-05-2022 / PICYDT UNM VII 2021
Nombre del Proyecto:
Identificación computacional de receptores de tipo quinasas asociadas a respuesta de defensa a patógenos en el pangenoma de girasol
Resumen:
Los estreses bióticos reducen el rendimiento de los cultivos, constituyendo una amenaza a la seguridad alimentaria mundial, por lo que la obtención de cultivares resistentes a enfermedades es uno de los principales objetivos del fitomejoramiento. La resistencia de amplio espectro es un rasgo deseable porque confiere resistencia contra más de una especie de patógeno o contra la mayoría de las razas o cepas del mismo patógeno. Muchos de los loci que confieren resistencia de amplio espectro codifican para receptores de reconocimiento de patrones (PRR), entre ellos receptores de tipo quinasa (RLK). Estos receptores pertenecen a grandes familias de genes/proteínas cuya clasificación computacional es dificultosa. En este proyecto, nos proponemos llevar a cabo un estudio integral y a nivel pangenoma de las proteínas RLK en girasol. Aunque las subfamilias de RLKs se han estudiado previamente en otras plantas, no se ha realizado ningún estudio exhaustivo sobre esta familia de genes en girasol (Helianthus annuus), segunda oleaginosa en importancia en Argentina. El presente proyecto propone partir del desarrollo de una estrategia para la identificación del kinoma (i.e. el repertorio completo de proteínas quinasas de la especie), seguido de unanálisis filogenético extendido, para la clasificación de las mismas. Usando datos de secuenciación a genoma completo de múltiples variedades cultivadas y silvestres de Helianthus, se hará un estudio de las variantes puntuales, estructurales y de presencia/ausencia que afecten a los mismos. Finalmente, se hará una validación funcional de RLKs candidatas, como potencial herramienta para el mejoramiento del cultivo. Este constituye el primer estudio de caracterización pan genómica de proteínas quinasas, y puntualmente RLKs, en girasol cultivado.
Unidad:
Departamento de Ciencias Aplicadas y Tecnología. Programa para la Investigación e Innovación en Biotecnología
Línea Prioritaria:
Investigación e Innovación en Biotecnología
Sublínea Prioritaria:
Bioprocesos y aplicaciones biotecnológicas
Fuente de Financiamiento:
UNM
Fecha de Inicio:
01/08/2022
Fecha de Finalización:
31/07/2024
Etapa:
Finalizado
Director/a - Inv. Responsable:
Filippi, Carla Valeria (DCAYT)
Codirección:
Lía , Verónica (Externo: INTA)
Integrantes:
Aguirre, Natalia Cristina (DCAYT) - Rivarola, Máximo Lisandro (DCAYT) - Rivas , Juan Gabriel (DCAYT) - Villalba, Pamela Victoria (DCAYT) - Gonzalez, Yesica. Auxiliar estudiante (DCAYT) - Gramajo, Leila Maricel. Auxiliar estudiante (DCAYT) - Tolentino Vásquez, Miguel Angel . Auxiliar graduado (DCAYT) - Paniego, Norma (Externo: Org. EXT)
Palabras Clave:
Girasol, Pangenoma, quinasa, RLK.
Aprobación:
UNM-SDI 43/22 - Prórroga:
Ver en Repositorio Digital:
Volver